L'Unité de la police scientifique dépendant de la division de la police criminelle de la Ertzaintza fut mise en place en 1990. Depuis lors, elle développe ses fonctions qui sont fondamentalement :
• D'assurer des services de criminalistique, d'identification, d'analyse et d'investigation technique propres à la Police scientifique pour répondre aux demandes qui se font jour en matière d'investigation.
• Elaborer des rapports d'expertise et documentaires qui lui seront commandés par les organes judiciaires.
Pour ce faire, l'unité est structurée en services d'identification et de laboratoire policier, et différentes sections : lophoscopie et inspections oculaires, identification des personnes, examen de documents et graphistique, balistique et traces instrumentales, génétique et médecine légale, chimie et nouvelles technologies.
Depuis décembre 2006, l'unité de la police scientifique appartient à l'ENFSI (European Network of Forensic Science), organisation qui rassemble des instituts de sciences légales en Europe et constitue un important forum pour l'échange d'expériences et la connaissance des nouvelles techniques et progrès qui se produisent dans le domaine des sciences de médecine légale au niveau européen.
En 2006, on commence à l'introduire dans le Système de Management de la Qualité.
Depuis 2008. A ce jour, l'Unité de la police scientifique a reçu la certification pour le signalement physonomique répondant à la norme UNE-EN ISO 9001. Elle possède par ailleurs l'accréditation du domaine de la génétique légale et de l'identification de la part de l'ENAC (Organisme national d'accréditation), sous la norme ISO/IEC 17025:2005. D'autres processus font actuellement l'objet de développement.
Les procédures spécifiquement développées sont relatives à la planification de la qualité des essais et à leur contrôle, au traitement des cas d'analyse ADN, d'identification, au signalement, aux prises d'empreintes dédactylaires et palmaires ainsi qu'aux signalements physonomiques, à la gestion des équipements et des installations, à l'ordre et la propreté comme moyen pour garantir la qualité des traitements réalisés, à l'exploitation de l'espace, à l'amélioration de l'efficacité et de la sécurité.
L'évaluation de la satisfaction des parties intéressées redevient une marque d'identité dans les processus ouverts dans le cadre de l'UPC.
A noter également une autre série de procédures et d'instructions opérationnelles qui complètent la base documentaire et technique servant à aborder les activités certifiées et/ou accréditées sous la norme ISO.
L’unite de déminage